20世纪70年代末，湖北中医药大学率先在全国成立生物医学工程研究室和中医控制论研究室，1987年以此为基础成立中医工程研究所，持续开展计算机中医辨证论治、中医专家系统、医院管理信息系统和医用文字信息处理技术研究。2006年，湖北中医药大学将中医工程研究所与相关医学信息研究资源整合，正式成立中医药标准化与信息技术研究所。2008年，经国家中医药管理局批准在湖北中医药大学设立以研究所为基础的国家中医药标准化技术培训与研究中心试点建设单位，主要负责中医药标准化、信息化领域的重大研究课题和人才培养任务。2013年，国家中医药管理局在我校建立了“中医药项目预算执行动态监控平台全国技术服务保障中心”，办公场所设在研究所。

研究所依托信息工程学院拥有专职研究人员和固定研究人员十余人，其中教授职称人员4人，副教授3人。经团队人员努力，现已形成中医药标准化、中医药信息化、医院信息管理与信息系统、中医临床数据处理与分析等研究方向。各研究方向均由高级职称在职在岗老师牵头负责，组织开展项目研究。研究所在黄家湖校区信息楼和昙华林校区2号楼设有固定办公地点和研究室，面积在200m²以上，很好地保障了日常研究工作的开展。

研究所着重开展中医药行业标准化、信息化规划，中医药标准制修订技术与方法学研究，中医药信息标准制修订与推广应用和中医药信息化建设与研究工作，使信息技术融入标准化、标准规范融入信息化，实现中医药标准化与信息化的双向融合，全面深化中医药标准化与信息化。近五年承担纵横向课题60余项，承担了国家中医药管理局中医药信息标准编制研究项目、“十三五”中医药信息化建设与发展规划与国家政务信息化工程建设规划中医药项目建议书编制研究、中医药健康服务互联网发展研究、中医药综合统计试点等中医药标准化、信息化专题研究项目。同时承担了中医药项目预算执行动态监控平台、中医药项目绩效管理信息系统、中医药项目预算精细化监控管理系统在全国的推广应用工作。

中医药标准化与信息化研究成果先后获得省部级科技进步一等奖3项，科技进步二等奖6项，多项三等奖和优秀软件奖。2009年获得中国标准创新贡献奖一、二等奖各一项。2014、2015年连续两年获得中华中医药学会政策研究奖。2013年，编制出版了中医医院信息化建设示范工程丛书一套四本，《中医医院信息化建设与管理》、《中医医院信息化研究进展与新技术应用》、《中医药标准化概论》和《中医医院信息系统规划与设计》，其中《中医医院信息系统规划与设计》获2016年度中华中医药学会学术著作奖三等奖。